《少年包青2》承接《少年包青天》的故事发展，包拯同公孙策、展昭，加上王朝、马汉等继续为民请命，推理侦查，周旋于种种令人拍案叫绝的悬疑奇案之中……
包拯接到宋仁宗的紧急传召，要他立即上京查案。原来赈济水灾的一笔官银，被发现遭到有关官员贪污后，朝中不少官员离奇死亡，皇上深知此事必与朝中贪污舞弊之风有关，决定要追查到底。仁宗苦无良策，只好请包拯“出山”，并赐予他皇帝密令找出事情原因，包拯这一次可以说是挑战满朝权贵，危机重重。
